角膜移植术包括：板层角膜移植术、穿透性角膜移植术、角膜内皮移植术以及人工角膜移植术。手术前，医生会根据角膜病变的不同种类、病情发展的不同程度、治疗时机及手术治疗目的，进行手术方式的选择，来达到预期的手术治疗目的，取得满意的疗效。
 
一、板层角膜移植术：包括部分板层角膜移植术、全板层角膜移植术（眼表重建术）及角膜内皮移植术。
(1)部分板层角膜移植术是切除病变区角膜组织，保留深部透明角膜组织为植床，以健康透明的角膜材料替换修补病变部分角膜的一种手术方式。切除病变角膜组织后保留的植床很薄，甚至仅留后弹力层和内皮层。所以这种术式适合于角膜病变未侵犯角膜深基质深层，内皮生理功能健康者。临床常用于：浅层角膜或角膜营养不良导致的基质混浊，进行性角膜炎及溃疡药物治疗困难或无效者、未侵犯深层基质的角膜肿瘤。
 
(2)全板层角膜移植术，也称为眼表重建术。手术时切除包括角膜缘外2mm范围的全角膜浅层病变组织，并使用同范围新鲜角膜供体材料替换修复病变区。主要适用于：眼部的酸碱等化学物质烧伤、眼的热烫伤以及病毒性角膜炎等其他损害了角膜缘干细胞组织，且不能修复的各种眼表疾病。如果深层角膜组织透明，全板层角膜移植即可恢复和改善伤眼部分视力。如果外伤导致全层角膜瘢痕或者是角膜内皮功能失代偿，全板层角膜移植术则为后期行中央部穿透性角膜移植术创造进一步手术治疗的条件。
 
(3)角膜内皮移植术（DSEK）是一项新近开展起来的角膜移植手术。它由板层角膜移植手术发展而来，以微创的模式使用健康的供体角膜内皮组织替换治疗各种原因引起的角膜失代偿（即大泡性角膜病变）。改变了传统的穿透性角膜移植手术方式，保留了患者自体完整的角膜上皮层和基质层（即90%自体的角膜组织），仅去除病变的角膜内皮层和后弹力层。DSEK手术快速、安全、损伤小、并发症少、恢复时间短，而且术后视力较好。适合于仅有角膜内皮病变的患者，如：不伴有角膜基质浑浊的大泡性角膜病变、基质透明的角膜内皮营养不良等。
 
二、穿透性角膜移植术
是以全层透明角膜代替全层病变混浊角膜的方法。适应症按其手术目的可分为光学性、治疗性、美容性等。光学性角膜移植术的目的是改善病变角膜的光学透明性，以提高视力。常见的适应症为：圆锥角膜、各种原因所致的角膜瘢痕、各种角膜营养不良、各种原因所致的角膜内皮细胞功能衰竭。治疗性角膜移植术的目的是为了切除病变组织，恢复和保持眼球形态结构。适应症为药物保守治疗无效或者疗效不佳，有眼球穿孔危险的化脓性角膜疡、眼化学伤、蚕蚀性角膜溃疡、角膜边缘变性、韦格内肉芽肿所致的角巩膜坏死、复发性翼状胬肉、角膜皮样肿、角结膜鳞状上皮癌等。美容性角膜移植术仅为了去除病变区形态颜色不正常的角膜，改善容貌。
 
三、人工角膜移植术
人工角膜目前有透明医用高分子材料制成和异种动物（常见为  猪）角膜脱细胞制作而成。透明的医用高分子材料制成的特殊光学装置，通过手术将它植入角膜组织中，以取代部分角膜瘢痕组织，可以恢复一部分视力，仅适用于患各种严重角膜疾患后的双目失明，特别是严重的化学烧伤引起的全部角膜白斑和多次角膜移植术失败不适合再行常规角膜移植术者。异种动物脱细胞制作的人工角膜，适合于板层角膜移植术。由于人工角膜稳定性较差、以及排异的高风险性，目前只适合于角膜材料缺乏或者不适合行常规角膜移植的情形。